larger block flash에 맞게 nand 쪽 드라이버를 수정해 주셨는지요?
기존 2440 소스의 경우 small block nand flash 인데.. 음..

read가 에러난다는 것은 보통 small block nand flash 소스를 가지고,
larger block nand flash를 엑세스 하려했을때 나타납니다.

MP2530F에서는 이런 증상이 있었으니 참고하세요. ^^

아래는 현재 nand 설정 부분입니다.
/* NAND configuration */
#define CFG_MAX_NAND_DEVICE 1

#define CFG_NAND_BASE (0x4e000010)
#define NAND_MAX_FLOORS 1
#define NAND_MAX_CHIPS 1
#define NAND_ChipID_UNKNOWN 0x00
//#define SECTORSIZE 2048
#define SECTORSIZE 1024

#define ADDR_COLUMN 1

#define ADDR_PAGE 2
#define ADDR_COLUMN_PAGE 3

#define NAND_DISABLE_CE(nand) (NFCONT_REG |= (1 << 1))
#define NAND_ENABLE_CE(nand) (NFCONT_REG &= ~(1 << 1))

#define CFG_NAND_SKIP_BAD_DOT_I 1 /* ".i" read skips bad blocks */

#define CFG_NAND_WP 1

#define NAND_WP_OFF() do { NFCONT_REG &= ~(1 << 12); } while(0)
#define NAND_WP_ON() ;

#define NAND_OOB_SIZE (64)
//#define NAND_PAGES_IN_BLOCK (32)
//#define NAND_PAGE_SIZE (512)
#define NAND_PAGES_IN_BLOCK (64)
#define NAND_PAGE_SIZE (2048)



#define NAND_BLOCK_SIZE (NAND_PAGE_SIZE*NAND_PAGES_IN_BLOCK)
#define NAND_BLOCK_CNT (4096)
#define NAND_BLOCK_MASK (NAND_BLOCK_SIZE - 1)
#define NAND_PAGE_MASK (NAND_PAGE_SIZE - 1)

Larger Block NAND Flash의 OOB 영역 크기가 64였나요?
512인 것으로 알고 있는데... 전체적으로 다시 한번 검토해 보셔야 할 것 같네요.
S3C6400용 부트로더에 K9G1G08U0B NAND가 이식되어 있으므로, 이것을 참고하여 수정해 보시면 될 것 같습니다.